La linea Myriapod NGS Dry propone pannelli per il sequenziamento di nuova generazione (NGS) per DNA ed RNA che permettono lo studio delle varianti geniche (SNP, In/del, fusioni, CNV) di rilievo predittivo-diagnostico-prognostico, associate alle neoplasie più frequenti, quali: colon, polmone, melanoma, sistema nervoso centrale, GIST, tiroide, vescica, mammella, ovaio, pancreas e prostata oltre a marker tessuto indipendenti, come le fusioni dei geni NTRK 1, 2 e 3.
Caratteristiche principali:
- Pronti all’uso: reagenti pre aliquotati su strip e in formato liofilo.
- Semplici: il workflow di lavoro più semplice e veloce del mercato per la preparazione di librerie NGS, con un hands-on time < 2 ore per seduta e un tempo stimato, dal campione al sequenziamento, di 8 ore.
- Completi: i pannelli includono tutti i biomarcatori a DNA ed RNA di rilevanza clinica per i tumori di maggior frequenza come quelli di colon, polmone, melanoma, sistema nervoso centrale, GIST, tiroide, vescica, mammella, ovaio, pancreas e prostata.
- Flessibili: ottimizzati su Illumina® Miseq™, MiniSeq™ e iSeql100™ con la possibilità di testare da 2 a 46 campioni per seduta.
- Bassa quantità e qualità di input: validati per lavorare a partire da 10 ng/reazione di DNA ed RNA estratti da FFPE o cfDNA, tessuto fresco o sangue intero a seconda dell’applicazione.
- Certificati: protocollo interamente CE-IVD, dal campione al risultato con elaborazione dei dati attraverso Myriapod® NGS Data Analysis Software, completamente automatica, in locale e senza l’utilizzo di Cloud.
WORKFLOW
Principio del metodo: il kit Myriapod® NGS Cancer panel DNA permette la preparazione di librerie Next Generation Sequencing (NGS) compatibili con le piattaforme Illumina “MiSeq®”, “MiniSeq™” e “iSeq™ 100” per l’identificazione di SNV e indels in 16 geni di rilievo clinico-diagnostico.
Materiale di partenza: DNA genomico, purificato e non, isolato da tessuto tumorale (fresco, congelato, fissato in formalina incluso in paraffina (FFPE)) o Plasma (cfDNA); è possibile utilizzare i reagenti di estrazione inclusi nel kit per l’estrazione del DNA da campioni FFPE.
Destinazione d’uso: flusso di lavoro CE IVD dall’estrazione all’analisi bionformatica di 17 geni le cui alterazioni sono implicate in numerosi tipi di tumore.
Geni inclusi nel pannello:
Principio del metodo: Il kit Myriapod NGS Cancer panel RNA” permette la preparazione di librerie Next Generation Sequencing (NGS) compatibili con le piattaforme Illumina “MiSeq”, “MiniSeq™” e “iSeq™ 100” per l’identificazione di oltre 1000 eventi di fusione in 10 geni di rilievo clinico-diagnostico.
Materiale di partenza: RNA isolato da tessuto tumorale (fresco, congelato, fissato in formalina incluso in paraffina (FFPE)) o da agoasporati (FNA).
Destinazione d’uso: flusso di lavoro CE IVD dall’estrazione all’analisi bionformatica per lo studio di 10 fusioni geniche di interesse predittivo-diagnostico per i tumori di polmone (ROS1, RET, ALK, MET), tiroide (RET, ALK, PPARG), vescica (FGFR2, FGFR3), colangiocarcinoma (FGFR2) e i marker agnostici (tessuto aspecifici) NTRK1, NTRK2, NTRK3. I target analizzati sono in linea con quanto richiesto dai criteri di prescrivibilità (LEA- Livelli essenziali di assistenza), dalle raccomandazioni AIOM-SIAPEC e dalle note informative AIFA.
Geni inclusi nel pannello:
Principio del metodo: Il kit Myriapod® NGS BRCA 1-2, attraverso due reazioni di PCR multiplex, consente di preparare librerie di Next Generation Sequencing (NGS) compatibili con le piattaforme Miseq, iSeq 100 e MiniSeq, comprendenti l’intera sequenza codificante, le giunzioni esone-introne (almeno 10 basi fiancheggianti) e parzialmente le regioni 5′ e 3′ UTR dei geni BRCA1 e BRCA2.
Materiale di partenza: DNA genomico, isolato da sangue intero in EDTA e da tessuto tumorale incluso in paraffina e fissato in formalina (FFPE).
Uso previsto: Myriapod® NGS BRCA 1-2 panel è un test diagnostico in vitro per l’identificazione di polimorfismi a singolo nucleotide (SNV), inserzioni-delezioni (indel) e variazioni del numero di copie (CNV) dei geni BRCA1 e BRCA2.
L’esternalizzazione dell’analisi dei dati / dei campioni non elimina la responsabilità legale del laboratorio nel trattamento dei dati personali, nemmeno se tutelata da complessi contratti con il fornitore dei servizi e lo stesso è certificato secondo uno standard per “Information Security Management” (es. ISO 27001).
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Categoria
Next Generation Sequencing